Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB25P57735 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB25P57735 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB25P57735 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms