Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms