Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK1P57059 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK1P57059 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms