Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPTEP56180 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPTEP56180 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPTEP56180 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPTEP56180 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPTEP56180 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms