Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP9P55211 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP9P55211 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms