Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD23AP54725 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms