Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms