Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRS3P32247 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms