Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB2P29033 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB2P29033 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms