Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms