Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms