Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
DNMT1P26358 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT1P26358 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT1P26358 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT1P26358 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DNMT1P26358 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT1P26358 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNMT1P26358 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms