Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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