Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAMP1P23763 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms