Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GCSHP23434 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GCSHP23434 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GCSHP23434 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GCSHP23434 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSHP23434 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSHP23434 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSHP23434 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSHP23434 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSHP23434 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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