Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF1BP20333 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms