Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPI1P17947 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPI1P17947 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms