Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms