Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME1P15531 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME1P15531 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME1P15531 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME1P15531 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms