Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPBP07199 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPBP07199 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms