Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTAP01040 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTAP01040 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms