Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4FO95754 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4FO95754 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms