Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms