Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EEDO75530 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EEDO75530 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EEDO75530 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEDO75530 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEDO75530 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms