Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F6O75461 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms