Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms