Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOBOXO60393 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOBOXO60393 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms