Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP9BO43861 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms