Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms