Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms