Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms