Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4O00268 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4O00268 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4O00268 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4O00268 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4O00268 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4O00268 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4O00268 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4O00268 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4O00268 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms