Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCER2I3L3R5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms