Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms