Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZK1P1A8MUH7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms