Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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