Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF22A3QJZ6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms