Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC144AA2RUR9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms