Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms