Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms