Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms