Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRELID3BQ9Y3B1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms