Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms