Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPS28Q9Y2Q9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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