Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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