Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms