Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FBXO4Q9UKT5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms