Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms