Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPN3Q9UHW5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPN3Q9UHW5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms