Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms